Фамилия Сонко — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В отличие от большинства русских фамилий, она не оканчивается на -ов, -ев или -ин, что сразу указывает на нетипичную модель образования. Скорее всего, перед нами фамилия не великорусского, а украинского, белорусского или польского корня, где суффикс -ко (уменьшительно-ласкательный или патронимический) встречается сплошь и рядом. В ономастике этот формант хорошо известен: он образует фамилии от личных имён, прозвищ или названий профессий, примерно как Иванько (от Иван) или Шевченко (от шевец — сапожник).

Основа «Сон-» может восходить к нескольким источникам. Первый и самый простой — крестильное имя Соня, уменьшительное от Софья (греч. «мудрость»). В таком случае фамилия Сонко могла возникнуть как «Сонько» (с мягким знаком) — сын или потомок Софьи. Со временем мягкость утратилась, и написание закрепилось без неё. Вторая версия — прозвище Соня, которое давали сонливому, медлительному человеку. В говорах «соня» означало не только любителя поспать, но и рассеянного, задумчивого человека. Третья, менее вероятная, — связь с тюркским корнем «сон» (последний, конец) или с финно-угорским «сонко» (болото, топь), но для центральной и западной России это уже экзотика.

Географически фамилия Сонко чаще всего встречается на западе и юго-западе бывшей Российской империи: в современной Украине, Беларуси, а также в приграничных областях России — Брянской, Смоленской, Псковской. В XIX веке носители фамилии были преимущественно крестьянами или мещанами, реже — казаками. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована, что косвенно подтверждает её простонародное происхождение от прозвища или уменьшительного имени.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Сонькин, Сонин — типично русские варианты с суффиксами притяжательности. Сонков — фамилия, образованная по той же модели, но с русским окончанием. Сонко же стоит особняком: её форма указывает на украинскую или белорусскую языковую среду, где суффикс -ко сохранился как основной способ фамильного словообразования. Если ваш предок носил фамилию Сонко, он, скорее всего, происходил из семьи, где говорили на западнорусских говорах, и его прозвище или имя было связано либо с мудростью (через Софью), либо с привычкой подолгу спать.