Фамилия Спиркина образована от обиходной формы старинного русского имени Спиридон. В крестьянской и рабочей среде полные имена часто сокращали до короткого, домашнего варианта — так Спиридон превращался в Спирку. Именно от этого прозвищного имени и пошла фамилия: сын Спирки становился Спиркиным, а его дочь или жена — Спиркиной.

Само имя Спиридон имеет две версии происхождения. По одной, оно восходит к греческому слову, которое переводится как «дар души». По другой — к латинскому личному имени, означавшему «рожденный вне брака». Первая версия выглядит правдоподобнее: в греческой традиции имя было связано с понятием духовного дара, а латинское толкование, скорее всего, возникло позже как народное переосмысление.

Модель образования фамилии простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на согласный. Так же устроены фамилии Фомин, Никитин, Саввин. Ударение в фамилии падает на первый слог — Спи́ркина, что тоже указывает на её народное, не книжное происхождение.

Среди однофамильцев известен Александр Спиркин (1919 год рождения) — российский философ и психолог, доктор наук, работавший над проблемами кибернетики и философии сознания. Его судьба — редкий пример того, как потомок человека с простым именем Спирка поднялся до вершин академической науки.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных регионах России, где имя Спиридон было особенно распространено в XIX веке. В документах того времени можно найти записи о крестьянах и мещанах Спиркиных, что подтверждает: основатель рода был выходцем из рабочей или крестьянской среды, а не из дворянского сословия.