Фамилия Спиженко — украинская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -енко. В украинской ономастике формант -енко означает «сын», «потомок» или «принадлежащий к роду», то есть Спиженко — буквально «сын Спижого». Вопрос в том, от какого именно слова образована основа.

Самое прямое объяснение — от прозвища Спиж, Спижий, которое могло возникнуть от глагола «спижать» или «спижить». В украинских и южнорусских говорах это слово означало «торопить», «гнать», «спешить». Спиж — человек торопливый, суетливый, либо, наоборот, тот, кто постоянно подгоняет других. В быту такое прозвище давали непоседам или тем, кто вечно куда-то бежал.

Вторая версия менее очевидная, но имеет право на существование: связь с диалектным «спиж» — вид пшеницы или зерна, похожий на полбу. В таком случае прозвище могло относиться к крестьянину, выращивавшему или торговавшему этим злаком. Однако эта гипотеза слабее: нет устойчивого бытования «спиж» как названия растения в широких слоях населения, а глагольная основа встречается в фамилиях чаще.

Фамилия Спиженко — довольно редкая. Её концентрация заметна в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской и Полтавской областях. Это типичная фамилия крестьянского или казацкого сословия, которая фиксировалась в метрических книгах и ревизских сказках XIX века, но не попала в дворянские родословные. В России встречается редко, в основном как результат миграции с Украины.

Словообразовательный разбор прост: корень «спиж-» (от прозвища), суффикс «-енко» (родовая принадлежность). Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Спиже́нко, хотя в разговорной речи встречается и вариант на первый. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то ближайшие — Спиж, Спижаков, Спижаченко, но все они менее распространены.