Фамилия Стахира — редкая и нестандартная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не связано с русской крестьянской средой, где фамилии чаще всего образовывались от имён, прозвищ или профессий через суффиксы -ов, -ев, -ин. Здесь же мы видим «голую» основу, без типичного родового окончания. Это сразу указывает на иноязычный источник.

Скорее всего, фамилия Стахира — это русифицированная форма греческого имени Стахий (Στάχυς). В православных святцах есть святой апостол Стахий, один из семидесяти учеников Христа, которого упоминает апостол Павел в Послании к Римлянам. Имя Стахий в переводе с греческого означает «колос» — символ плодородия и зрелости. В народной среде на Руси это редкое календарное имя могло трансформироваться: отпадение конечного звука или замена его на «а» дало форму Стахир. Такое «опрощение» имени встречалось: например, Парфён мог превратиться в Парфёра, а Евтихий — в Евтиха.

Другая, менее вероятная версия — происхождение от тюркского слова «стахыр» (стойкий, крепкий) или от арабского «стахир» (знаменитый, прославленный). Но эти гипотезы слабее, потому что фамилия не имеет типичных тюркских формантов (-ов, -ев, -оглы), а в арабском корне нет привычного для славянского уха звучания. Правдоподобнее всего — греческая основа, через церковную книжность.

Социальный контекст: носители фамилии Стахира могли быть потомками духовенства или людей, получивших имя по святцам. В XIX веке такие редкие «непатронимические» фамилии встречались у выходцев из южнорусских и украинских губерний, где влияние греческой церковной традиции было сильнее, а также у обрусевших греков. Географически фамилия сегодня встречается единично, преимущественно на юге России и в восточной Украине, что подтверждает её локальный характер.

С точки зрения словообразовательной модели, Стахира — фамилия-прозвище в чистом виде, без суффикса принадлежности. Это ставит её в один ряд с такими редкими формами, как Варнава, Фока или Агап. В русской ономастике такие «усечённые» фамилии часто свидетельствуют о позднем закреплении или о том, что предок был носителем имени, которое не переделали в отчество.