Фамилия Сташенин образована от прозвища или нецерковного имени Сташеня. В основе лежит глагол «сташить» — в северных и сибирских говорах это слово означало «стащить, утащить, украсть». Соответственно, Сташеней в старину могли назвать человека, склонного к мелкому воровству, либо того, кто однажды «сташил» что-то важное, и прозвище закрепилось.

Модель образования типична для русских фамилий: основа Сташен- плюс суффикс принадлежности -ин, указывающий на то, что речь идёт о потомке человека по имени Сташеня. Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов на -а/-я, и широко распространён на севере и в центре России. Фамилия Сташенин встречается в документах XVII–XVIII веков, преимущественно на Вятке и в Пермской губернии, что подтверждает её севернорусское происхождение.

Существует и менее вероятная версия: от имени Евстафий через его просторечные формы Стахей или Сташа. В этом случае Сташеня — уменьшительное от Стахей, а фамилия означала бы «сын Сташени». Однако эта гипотеза слабее, потому что от имени Евстафий в русских фамилиях чаще встречаются основы Стахеев, Астафьев, а не Сташен-. Прозвищное происхождение от «сташить» подтверждается и тем, что в тех же говорах известно слово «сташной» — вороватый.

По сословному составу Сташенины — крестьянская фамилия. В ревизских сказках XIX века она фиксируется в основном среди государственных крестьян Вятской губернии, реже — у бывших помещичьих крестьян. Дворянских родов с такой фамилией не отмечено.