Фамилия Стенюгин образована по модели, которая широко встречается у восточных, западных и южных славян, и потому её смело можно назвать самобытным памятником славянской культуры. В её основе лежит личное имя или прозвище Стенюга. Так на Руси могли называть человека, который был как-то связан со Степаном — это уменьшительная форма от имени Степан (от греческого «стефанос» — венок, корона). Суффикс -юг- придавал имени фамильярный, бытовой оттенок, а фамильный суффикс -ин указывал на принадлежность: Стенюгин буквально значит «сын Стенюги», «из семьи Стенюги».

Впрочем, возможен и другой путь. В северных и вятских говорах «стенюга» могло быть прозвищем рослого, широкоплечего человека, которого сравнивали со стеной. Тогда фамилия отражает не имя, а внешнюю черту предка. Какая версия правдоподобнее? Для фамилий на -ин чаще работала первая схема — от канонического имени через уменьшительную форму. Но прозвищный след исключать нельзя: в народной среде оба пути часто пересекались.

Носитель фамилии Стенюгин может по праву гордиться ею как ценным источником семейной истории: передаваясь из поколения в поколение, она по сей день хранит память о происхождении индивида. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте появления фамилии Стенюгин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований — например, изучения писцовых книг или ревизских сказок, где фиксировались крестьянские и посадские семьи.

Редкость фамилии объясняется просто: имя Стенюга никогда не было столь же частым, как, скажем, Степанов или Степаненко. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Стенюгин. Встречается она преимущественно в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её великорусское происхождение: именно там уменьшительные формы на -юга были особенно употребительны.