Фамилия Стенюхин — редкий случай, когда основа почти наверняка связана с личным именем, но точное исходное имя приходится восстанавливать через цепочку словообразовательных звеньев. Если отбросить фамильный суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей сын?»), остаётся основа Стенюх-. В ней выделяется суффикс -юх-, который в русских фамилиях часто служит для образования «сыновьих» форм от уменьшительных имён: ср. Петюха (от Пётр), Ванюха (от Иван). Значит, Стенюха — это разговорное, возможно, диалектное производное от какого-то полного имени.

Самая прямая версия: Стенюха — вариант имени Степан. В народной речи имя Степан давало множество сокращений: Степа, Стена, Стеня. Форма Стенюха (с суффиксом -юх-) вполне могла возникнуть в западных или южных говорах, где было распространено «аканье» и смягчение согласных. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит имя Стен (от Стенли или просто как прозвище), но для русской традиции XVII–XVIII веков, когда фамилия оформлялась, это нетипично. Таким образом, Стенюхин — это «сын Стенюхи» (то есть внук или потомок Степана).

Фамилия не относится к числу распространённых. Встречается она преимущественно на юге России и в Поволжье — в Воронежской, Ростовской, Волгоградской областях. Это косвенно подтверждает гипотезу о диалектном происхождении: именно в этих регионах имя Степан в устной речи могли переиначивать в «Стенюха». По сословной принадлежности носители такой фамилии в XIX веке были, скорее всего, государственными крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, осевших на южных рубежах. Дворянских родов Стенюхиных в «Бархатной книге» и других родословных сборниках не зафиксировано.

С точки зрения словообразования, фамилия Стенюхин стоит в одном ряду с такими же «сыновьими» формами от уменьшительных имён: Петюхин, Ванюхин, Сенюхин (от Семён). Общий принцип один: сначала от полного имени образовывали обиходную форму на -юха, а затем от неё — притяжательное прилагательное с суффиксом -ин. Никакой другой семантики — ни ремесла, ни прозвища по внешности — в основе не просматривается. Это чисто патронимическая фамилия, и её главная загадка — всего лишь точное звучание исходного имени, которое сегодня мы знаем как Степан.