Фамилия Стенютин — довольно редкая, и её происхождение напрямую связано с просторечной или диалектной формой крестильного имени. В основе лежит имя Стенюта — уменьшительно-ласкательный вариант от Степан (церковное Стефан, от греческого «стефанос» — венок, венец). В русской народной традиции имя Степан давало множество производных: Стеша, Стёпа, Стеня, а форма Стенюта с суффиксом -ют- характерна для северных и северо-западных говоров, где такие «усечённые» варианты с ласкательным оттенком были в ходу.

Фамилия образована по классической патронимической модели: Стенютин — «сын Стенюты». Суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному человеку, а не к роду в целом, что типично для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был потомком человека по имени или прозвищу Стенюта.

Интересно, что фамилия Стенютин стоит в одном ряду с более распространёнными Степанов, Степаненко, Степанчук, но её отличает именно разговорная, «домашняя» основа. В переписных книгах XVII–XVIII веков могли фиксировать не полное имя, а именно уличное прозвище, которое затем и закреплялось за детьми. Встречается фамилия преимущественно в центральных областях России и в Поволжье — регионах, где имя Степан было особенно популярно среди крестьян и посадских людей.

Отдельного внимания заслуживает написание: в некоторых старых документах можно найти вариант «Стенютин» с буквой «ѣ» (ять) в корне, что отражало диалектное произношение, но к концу XIX века форма с «е» закрепилась окончательно. Сословной привязки у фамилии нет — её могли носить как крестьяне, так и мещане, поскольку имя Степан было распространено во всех слоях общества, а уменьшительная форма не считалась простонародной в уничижительном смысле.