Мужское крестильное имя Стефан в переводе с древнегреческого означает «венок». В основу фамилии легла производная форма имени Степан - Степаниша. Скорее всего, основатель рода Степанишиных был выходцем из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Степаниша, со временем получил фамилию Степанишина.