Фамилия Степухина — женская форма от Степухин, а та, в свою очередь, образована от имени или прозвища Степуха. Это уменьшительно-ласкательная или просторечная форма от крестильного имени Степан (греч. stephanos — «венок, венец»). В русской народной традиции имена с суффиксом -ух- (-юх-) были распространены в быту: Степуха, Петруха, Митюха. Такие формы часто закреплялись как прозвища, а затем и как фамилии, особенно в среде крестьян и посадских людей, где полное церковное имя употреблялось реже, чем домашнее.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Степухин — «сын Степухи» или «человек из семьи Степухи». Это типичная модель русских фамилий, образованных от прозвищ или неканонических форм имени. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются у потомков по отцу с окончанием на согласный, -ин характерен для основ, заканчивающихся на -а/-я. Географически фамилия Степухин (и Степухина) тяготеет к центральным и южным регионам России, но не является узколокальной — её можно встретить в Рязанской, Тамбовской, Воронежской областях, а также среди казачества, где уменьшительные имена были особенно живучи.

Интересна параллель с однокоренными фамилиями: Степанов — самая распространённая фамилия от этого имени, Степанкин — более редкая, а Степухин стоит в ряду тех, что сохранили народную, «некнижную» форму. Если предок носителя фамилии был прозван Степухой, это могло указывать на его невысокий социальный статус (крестьянин, ремесленник) или, наоборот, на близость к простонародной среде, где не стеснялись домашних имён. В писцовых книгах и ревизских сказках XVI–XVII веков подобные фамилии фиксируются как «Степухин», «Степухин сын» — то есть фамилия уже тогда передавалась по наследству, а не была случайным прозвищем.

В дореволюционных записях встречается вариант написания «Степухина» без изменения ударения (оно падает на второй слог — Степу́хина). В современном русском языке фамилия склоняется по правилам притяжательных прилагательных, и её женская форма не меняется при замужестве. Споров о происхождении основы практически нет: все версии сходятся к имени Степан, и альтернативные гипотезы (например, от диалектного «степуха» — что-то связанное со степью) не имеют серьёзной поддержки в ономастике.