Фамилия Стомин — одна из тех, где вопрос упирается в корень. Если отбросить типовой русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»), остаётся основа Стом-. С ней и главная сложность: в русском языке нет очевидного слова «стом» или «стома». Значит, либо это искажённое звучание, либо фамилия образована от прозвища на базе заимствования.

Самая вероятная версия — греческое происхождение. В греческом языке «стома» (στόμα) означает «рот», «устье». Прозвище Стома могли дать человеку с большим ртом, говорливому или, наоборот, молчаливому. В южнорусских и украинских землях, где влияние греческой культуры через торговлю и переселение было заметно, такие прозвища встречались. Фамилия Стомин, таким образом, могла означать «сын Стомы» или «принадлежащий Стоме».

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с диалектным глаголом «стомить» — утомлять, изнурять. В некоторых говорах «стомный» означало «уставший», «измученный». Прозвище Стома мог получить человек медлительный или вялый. Но эта гипотеза слабее: глагол «стомить» редок, а фамилии от него обычно выглядят как Стомов, а не Стомин.

Интересно, что фамилия Стомин почти не встречается в центральных и северных областях России. Её география тяготеет к югу — Курская, Воронежская, Ростовская области, а также к украинским землям. Это косвенно подтверждает греческую версию: именно через Причерноморье и Крым греческие слова проникали в местные прозвища.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин, как у фамилий от основ на -а (Стома → Стомин). По такой же схеме образованы фамилии Фомин (от Фома), Савин (от Савва). Разница лишь в том, что Стома — не каноническое крестильное имя, а прозвище. Поэтому носители фамилии Стомин, скорее всего, потомки человека, которого в быту прозвали за характерную внешность или манеру речи.