Фамилия Стояничева — женская форма мужской фамилии Стояничев. Её основа — прозвище или нецерковное имя Стоян, которое в древнерусской и южнославянской традиции давали ребёнку, чтобы он «стоял крепко», то есть рос здоровым и устойчивым. В русских говорах «стояном» называли и упрямого, настойчивого человека, того, кто стоит на своём. В отличие от более частых фамилий Стоянов и Стоянович, модель на -ичев встречается реже и указывает на происхождение от патронима на -ич, то есть Стоянич — «сын Стояна». Суффикс -ев присоединился уже к отчеству, что типично для северных и центральных областей России, где фамилии на -ичев распространены шире, чем на юге.

Географически фамилия Стояничева не привязана к одной местности, но её корни уходят в регионы, где бытовали прозвища на -ян: это Рязанская, Тамбовская, Воронежская губернии, а также земли, заселённые выходцами с Украины и Белоруссии. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и однодворцы с фамилией Стояничев, что говорит о её непривилегированном происхождении — это не дворянская, а крестьянская или мещанская фамилия, образованная от бытового имени.

Редкость фамилии Стояничева объясняется тем, что модель на -ичев в русской ономастике менее продуктивна, чем на -ов или -ин. Она сохранилась в основном в тех родах, где отчество Стоянич закрепилось как фамильное прозвание до эпохи массового закрепления фамилий в XIX веке. Если сравнивать с однокоренными — Стоянов, Стоян, Стоянович — то Стояничев стоит особняком: в ней слышна не просто принадлежность отцу, а указание на родоначальника по прямой мужской линии, что делает фамилию более архаичной.

В современной России Стояничевы встречаются рассеянно, без ярко выраженного ареала. По данным переписей и телефонных справочников, носители фамилии живут в Москве, Санкт-Петербурге, а также в Волгоградской и Ростовской областях — это следствие миграций XX века. Фамилия не имеет отношения к глаголу «стоять» в прямом смысле (сторож, часовой), хотя народная этимология иногда связывает её с профессией. На деле — это память о человеке по имени Стоян, который жил четыре-пять веков назад.