Основой фамилии Стоянова послужило церковное имя Стоян. Фамилия Стоянова, согласно одной из гипотез, имеет болгарское происхождение и образована от крестильного мужского имени Стоян, которое в русском быту было весьма редким, зато в Болгарии и Сербии до сих пор распространено очень широко. Существует и такая версия: фамилия Стоянова происходит от русского прозвища Стоян, в основе которого лежит прилагательное «стойкий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Стоян, со временем получил фамилию Стоянова.