Основой фамилии Стояновский послужило церковное имя Стоян. По одной из них, она образована от крестильного мужского имени Стоян, которое в русском быту было весьма редким, зато в Болгарии и Сербии до сих пор распространено очень широко. Имя Стоян имеет греческое происхождение и в переводе на русский язык означает «воинственный». Согласно другой версии, фамилия Стоян происходит от прозвища Стоян, в основе которого лежит прилагательное «стойкий».