Фамилия Струнинский — одна из тех, где спокойно и без натяжек восстанавливается вся цепочка: от прозвища до фамильной модели. Она образована по типичной для восточнославянской ономастики схеме с суффиксом -ск(ий), который изначально указывал на принадлежность к местности или роду. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Струна.

Струной в старину называли не только музыкальную струну, но и длинный, тонкий предмет, жилистого и худощавого человека, а также — в некоторых говорах — непослушного, «струнного» ребенка. Прозвище было распространённым: в деловой письменности XV–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с именем Струна. От него пошли фамилии Струнин, Струнов, а форма Струнинский — это уже более поздняя, «дворянская» или географическая версия. Суффикс -ин- здесь указывает на прямое наследование: Струнинский буквально значит «сын Струны» или «выходец из семьи Струниных», а окончание -ский закрепилось за теми, кто переселился или получил землю.

В отличие от простых фамилий на -ов/-ев, которые у крестьян и мещан стали массовыми уже в XVIII–XIX веках, фамилии на -ский в России долго оставались маркером либо шляхетского происхождения (на западных землях), либо принадлежности к духовенству, которое часто брало фамилии по названиям сёл и приходов. Струнинский могла получить семья, переселившаяся из деревни Струнино или Струнинка — такие топонимы есть в нескольких областях: например, Струнино во Владимирской области, а также ряд мелких хуторов и урочищ с этим корнем. В этом случае фамилия отвечала на вопрос «откуда родом?» и закрепляла за человеком название покинутого места.

Спорных версий у Струнинского немного. Иногда её сближают с польским Strunski или западнорусскими фамилиями, где -ski — типичный дворянский формант. Но для русского уха и по законам словообразования основа «струн-» лежит на поверхности, и притягивать иноязычные корни нет нужды. Фамилия редкая, в списках массовых не числится, что говорит о локальном бытовании — скорее всего, в центральных и северных губерниях, где суффикс -ский охотно давали однодворцам и обедневшим дворянам.

Носитель фамилии Струнинский может с высокой долей вероятности считать, что его предок либо получил прозвище за внешность или характер, либо переехал из места с названием Струнино. Оба варианта ведут в XVI–XVII века, в среду крестьян, служилых людей или мелкопоместных дворян, и ни один не делает фамилию «непонятной» — напротив, это один из тех случаев, когда этимология прозрачна, а история укладывается в несколько строк.