Фамилия Субора — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного русского суффикса -ов или -ин, поэтому сразу понятно: перед нами не стандартная «патронимическая» фамилия, образованная от имени отца. Скорее всего, её корни лежат в прозвище или в заимствованном слове.

Самая прямая версия отсылает к диалектному или профессиональному слову «субор» или «суборь». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «суборью» называли хвойный лес, бор, а иногда — густой кустарник или лесную опушку. Человек, живший у такого леса или в нём, мог получить прозвище Субора. Фамилия в этом случае — «географическая», указывающая на место жительства предка. Суффикс -а здесь — не уменьшительный, а скорее признак того, что прозвище закрепилось в форме женского рода (по типу «левая рука — шуйца»), или же это вариант краткого прилагательного.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная, — связь с украинским или белорусским словом «субор» (суборъ), означающим «сбор», «собрание», «сходка». В таком случае прозвище мог получить человек, который организовывал сходы, или, наоборот, тот, кто был «сборным», не местным. Однако эта гипотеза слабее: фамилии с таким корнем в восточнославянском ареале почти не встречаются, а географическая привязка к лесу куда типичнее для прозвищ.

Фамилия Субора практически не имеет однокоренных «двойников» в русском ономастиконе. Нет распространённых Суборовых, Суборских — это подчёркивает её локальный, почти уникальный характер. Носители такой фамилии — потомки, скорее всего, крестьян или охотников из лесной полосы России: Архангельской, Вологодской областей, Приуралья. В дворянских родословных книгах фамилия не засветилась, что тоже подтверждает её простонародное, прозвищное происхождение.

Поскольку фамилия нечастотная, её написание могло колебаться: в старых документах встречаются варианты «Суборя», «Суборь». Но современное окончание на -а устойчиво и позволяет отличить фамилию от похожих, но других по смыслу слов.