Фамилия Суняйкин образована от имени Суняйка — уменьшительно-ласкательной формы старинного эрзянского имени Суняй. Такой способ словообразования типичен для мордовских фамилий: к основе имени добавляли суффикс -ка, а затем к этому прозвищу присоединяли русский патронимический суффикс -ин. Получается цепочка: Суняй → Суняйка → Суняйкин, то есть «сын Суняйки».

Значение исходного имени Суняй точно не установлено, и здесь исследователи расходятся. Наиболее осторожная версия связывает его с названием карельской реки Суна, известной своими водопадами. Но это лишь предположение, подкреплённое скорее созвучием, чем документальными свидетельствами. Есть и другая, более экзотическая гипотеза — о тюркском происхождении имени. В этом случае его возводят к чувашскому слову «сун» — «гореть» или «сунна» — «выжженное место». Если принять эту версию, то Суняйкой могли прозвать человека, пострадавшего от пожара или жившего на гари. Однако эта этимология выглядит менее убедительной: для эрзянских имён тюркские заимствования нехарактерны, а вот связь с собственными мордовскими именниками прослеживается чаще.

География фамилии говорит сама за себя. В документах начала XX века встречаются Суняйкины, записанные как мордва: Григорий Александрович, родившийся в 1904 году в деревне Ижбердино, и Григорий Яковлевич 1894 года рождения из Мордовии. Эти записи — не просто перечень имён, а важное свидетельство того, что фамилия бытовала в крестьянской среде и прочно держалась в пределах исконных мордовских земель. Суняйкины не были ни дворянами, ни купцами — это фамилия простого люда, сохранившая память о далёком предке по имени Суняй.