Фамилия Сусандин — редкий случай, когда в основе лежит не крестильное имя, а его разговорная форма с неочевидным суффиксальным оформлением. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать два ключевых элемента: корень и окончание.

Корень «Сусан-» восходит к библейскому женскому имени Сусанна (от древнееврейского שושנה — «лилия», «логос»). В русской народной традиции имя нередко видоизменялось: Сусанна превращалась в Сосану, Сусанку, а мужские производные от женских имён — явление хоть и нечастое, но возможное. Например, от имени Марфа образовывали фамилию Марфин, а от имени Степанида — Степанидин. Здесь работает та же модель: Сусандин — буквально «сын Сусанны».

Суффикс «-дин» указывает на притяжательное значение с оттенком родства. В русской ономастике это редкий вариант: обычно фамилии на «-ин» образуются от основ на -а/-я (Петин, Ильин), а «-дин» — это следствие того, что основа имени заканчивалась на -н (Сусан-а → Сусан-дин). Похожая модель встречается в фамилиях Марьин, Татьяндин, хотя последняя почти исчезла.

Географически Сусандины, скорее всего, происходят из регионов, где имя Сусанна было популярно в простонародной среде — например, среди старообрядцев или крестьян южнорусских и поволжских губерний. В переписных книгах XVIII–XIX веков это имя встречается редко, но стабильно, что делает фамилию не случайной, а осмысленной: предок носителя был либо сыном женщины по имени Сусанна, либо получил прозвище по её имени.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы предположить связь с тюркским «сусан» (камыш, тростник), но суффикс «-ин» для тюркских заимствований нетипичен, а имя Сусанна даёт более прямую и прозрачную этимологию. Так что основная версия — перед нами редкая патронимическая фамилия от женского библейского имени, сохранившая архаичную словообразовательную модель.