Фамилия Тишонков — довольно редкая и интересная по своей словообразовательной модели. В отличие от многих фамилий на -ов, образованных от полных или уменьшительных форм крестильных имён, здесь мы видим суффикс -онк- (в современном написании -онк-), который в русской антропонимии встречается нечасто и обычно указывает на западнорусское, белорусское или украинское происхождение основы.

Разберём фамилию по составу: корень ТИШ-, суффикс -ОНК- и фамильный суффикс -ОВ. Основа «Тишонок» — это уменьшительно-ласкательная форма от имени Тихон (от греческого «счастливый, удачливый»). В белорусском и украинском языках патронимический суффикс -онок/-онко широко использовался для обозначения сына или потомка («Тишонок» буквально — «маленький Тихон» или «сын Тихона»). В русском языке аналогичную роль выполнял суффикс -ович. Таким образом, Тишонков — это русифицированная форма фамилии Тишонок: при переселении носителей в центральные и северные области России к основе добавили стандартный русский суффикс -ов, чтобы адаптировать фамилию к местной грамматике.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии Тишонков происходил из белорусских или украинских земель (возможно, из Смоленщины или Брянщины, где такие формы распространены), а затем фамилия закрепилась в русской среде. Само имя Тихон было очень популярно в крестьянской среде, поэтому фамилия могла возникнуть независимо в разных местах. Интересно, что в некоторых говорах слово «тишонок» могло быть и прозвищем — так могли назвать тихого, спокойного ребёнка, но это менее вероятно, так как суффикс -онок в прозвищах встречается реже, чем в патронимах.

С точки зрения социальной истории, фамилии с суффиксом -онков (как Тишонков, Семёнков, Миронков) чаще всего принадлежали крестьянам и мещанам, а не дворянам. В документах XVI–XVII веков подобные формы фиксируются в южных и западных уездах Московского государства. Сегодня фамилия Тишонков встречается спорадически, преимущественно в центральной России и в Поволжье.