Фамилия Тофанова — женская форма от Тофанов, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Тофан. В отличие от многих русских фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён (Иван — Иванов), основа Тофан почти наверняка нецерковная и довольно редкая. Чтобы понять её корни, нужно смотреть не в святцы, а в диалекты и тюркские языки.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках, особенно в башкирском, татарском и казахском, есть слово «тофан» (или «туфан») — это «потоп», «наводнение», «буря». В переносном смысле такое прозвище могли дать человеку шумному, неспокойному или, наоборот, тому, кто родился во время сильного ненастья. Однако в русской среде фамилия могла появиться не напрямую от тюркского слова, а через географию: Тофановы часто встречаются в регионах Поволжья и Урала, где веками жили рядом русские и тюркские народы. Фамилия могла возникнуть как русифицированная форма татарской или башкирской фамилии Туфанов (с заменой «у» на «о» под влиянием акающих говоров).

Вторая, менее распространённая версия, связывает Тофан с греческим именем Феофан (Богоявление). В народном произношении «Феофан» могло сократиться до «Тофан» — такое упрощение характерно для бытовой речи (ср. Фёдор из Теодор). Но эта версия слабее, потому что от имени Феофан чаще образовывали фамилии Феофанов или Фофанов, а Тофанов — это уже более специфичный вариант, который мог закрепиться только в отдельных местностях.

Суффикс -ов указывает, что фамилия сформировалась как притяжательная: «чей?» — «Тофанов», то есть сын или потомок Тофана. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании. Если ваши предки Тофановы — скорее всего, они жили на стыке русских и тюркских земель, и их родовая память уходит к человеку, которого за характер или обстоятельства рождения прозвали «бурей» или «потопом».