Фамилия Тоганова — женская форма фамилии Тоганов. Её основа, «Тоган», неочевидна для русского уха, и это первый ключ к происхождению. Слово не встречается в древнерусских именах и прозвищах, зато хорошо ложится на тюркскую почву: в татарском, башкирском, казахском языках «тоган» означает «рождённый», «родной». В некоторых диалектах так называли младшего ребёнка или того, кто родился в определённый день (например, в праздник). Вероятнее всего, фамилию образовали от тюркского личного имени Тоган — охранительного имени, которое давали младенцу, чтобы подчеркнуть его кровную связь с родом.

Модель образования простая: к основе Тоган добавили русский патронимический суффикс -ов, а затем — женское окончание -а. Такая схема типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар или башкир, а также в смешанных русско-тюркских регионах — Поволжье, Приуралье, южный Урал. Носители фамилии Тогановы исторически могли быть выходцами из служилых татар, торговых людей или крестьян, принявших православие и вместе с ним русскую фамильную форму.

Есть и менее вероятная версия: от калмыцкого «тога» — «количество, число», с добавлением -н. Но она слаба, так как в калмыцкой антропонимии такие модели редки, а имя Тоган как личное встречается именно в тюркской среде. Таким образом, фамилия Тоганова — яркий пример того, как русский суффикс соединился с восточным корнем, сохранив память о родстве и происхождении предка.