Фамилия Томчишена — яркий пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Она образована по архаичной модели, которая почти не встречается в стандартных русских фамилиях на -ов или -ин. Основа здесь — мужское имя или прозвище Томчиш, которое, в свою очередь, является производной формой от крестильного имени Фома (от арамейского «близнец»). В русских говорах имя Фома часто переделывали в разговорные варианты: Тома, Томка, а уменьшительно-ласкательная форма с суффиксом -иш (Томчиш) означала «маленький Фома» или «сын Фомы».

Ключевая особенность — окончание -ена. Это не просто падежное окончание, а след так называемых «матронимических» или «жениных» фамилий, характерных для западнорусских земель (Смоленщина, Брянщина, Псковщина) и для украинского Полесья. В этой модели фамилия указывала не на отца, а на мужа: Томчишена — это «жена Томчиша». То есть, если мужчину звали Томчиш (сын Томы), то его жену в быту называли Томчишена, и это прозвище закрепилось за ней и её детьми как фамилия.

Встречается написание и через «о» — Томчишона, что не меняет сути, а лишь отражает местное произношение. В отличие от фамилий вроде Томчин или Томчиков, где суффикс указывает на прямое родство по отцу, Томчишена — редкий случай, когда в основе лежит социальная роль женщины в диалектной среде. Носитель этой фамилии почти наверняка имеет корни в деревнях на границе России и Беларуси, где такие формы были нормой вплоть до XIX века.