Фамилия Топырина образована от мужского прозвища Топыря, а оно, в свою очередь, от глагола «топырить» — растопыривать, отставлять в стороны, делать топорщащимся. В основе прозвища могла лежать характерная черта внешности или поведения: так могли назвать человека с торчащими ушами, взъерошенными волосами, оттопыренной губой или того, кто ходил, растопырив локти. Другая возможность — переносное значение: «топыриться» значило также важничать, чваниться, надуваться. В этом случае прозвище давали заносчивому или обидчивому человеку.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Топырина — это «дочь (или жена) Топыри». В русских фамилиях модель на -ин характерна для основ, оканчивающихся на -а или -я. Поскольку прозвище Топыря звучит как имя собственное, фамилия закрепилась в женской форме как указание на родство.

Географически фамилия редкая и тяготеет к северным и центральным регионам России. Встречается в Вологодской, Кировской областях и в Пермском крае — местах, где сохранились старые говоры и прозвищные формы. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне с прозвищем Топырь, например, в новгородских и вологодских землях. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в крестьянской среде, а не в дворянской.

Фамилия Топырина — не единственная в этом гнезде. Однокоренные Топырин, Топыркин, Топырщиков, Топыряев. Все они восходят к тому же выразительному глаголу, но различаются суффиксами и диалектными вариантами. Если Топырин и Топырина — самая прямая форма, то Топыркин, например, образован от уменьшительного Топырька.

Искать знаменитых носителей фамилии Топырина в истории сложно: фамилия не была распространена среди знати и не попала в родословные книги. Однако это не делает её менее ценной для изучения: она сохранила живую народную основу, которая за двести-триста лет почти не изменилась.