Фамилия Трахановская — редкий случай, когда основа ясна, а суффикс сразу выдаёт происхождение. Это типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + -ский/-ская». Такие фамилии в XVIII–XIX веках получали дворяне и духовенство по названию своих поместий или сёл, а также выходцы из этих мест при переезде.

Корень «Трахан-» почти наверняка восходит к топониму — селу или деревне Траханово (или Трахань). Такие названия встречаются в разных регионах, но особенно характерны для запада России, Беларуси и Украины. Само слово «Трахан» — это, скорее всего, прозвище или личное имя. В старину «трахан» (или «трах») могли называть человека с грубоватым, резким нравом, либо это была искажённая форма тюркского имени, например, от «тархан» — титула, означавшего свободного человека, освобождённого от податей. Версия с тюркским «тархан» правдоподобнее: в русских говорах «а» часто переходило в «о», а «р» могло выпадать, так что «Траханов» — прямой родственник фамилий Тарханов, Тарханский.

Таким образом, первый носитель фамилии Трахановская — женщина, либо дочь, либо жена человека по фамилии Трахановский. А тот, в свою очередь, был помещиком из села Траханово или священником, получившим фамилию по названию прихода. Суффикс «-ская» указывает на принадлежность к месту, а не на отчество, что отличает эту фамилию от более массовых «Траханов» (крестьянских, по отцу). Встречается написание через «о» — Трохановская, что подтверждает диалектное «аканье» или «оканье» в зависимости от региона.