Фамилия Трохаев образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — от личного имени или прозвища через суффикс принадлежности -ев. Основа здесь — Трохай, а суффикс указывает на то, что носитель фамилии — потомок человека по имени или прозвищу Трохай.

Сам корень «Трох-» — это народная, разговорная форма крестильного имени Трофим. В русских говорах имя Трофим часто сокращали и переделывали в Троха, Троша, Трохей. Суффикс -ай (-ей) в таких формах (Трохай, Трохей) характерен для обиходной, неофициальной речи: он придаёт имени оттенок простоты и близости. Так из имени Трофим родилось прозвище Трохай, которое затем закрепилось за родом.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с диалектным словом «трохать» — стучать, греметь. В этом случае прозвище Трохай могли дать шумному, громкоголосому человеку или, напротив, тому, кто работал с молотом, наковальней. Однако с учётом того, что имя Трофим на Руси было очень популярно, а фамилии на -аев/-еев от производных форм имён встречаются сплошь и рядом (Трохаев, Трошев, Трофимов), версия с Трофимом выглядит убедительнее.

Фамилия Трохаев — относительно редкая. Она не принадлежит к числу дворянских или купеческих родов, а скорее типична для крестьянской и мещанской среды центральной России и Поволжья, где имя Трофим было особенно распространено. Встречается также вариант написания с «о» под ударением — Троха́ев, хотя ударение может плавать в зависимости от местного говора.

В целом, если вы носите фамилию Трохаев, ваши предки, скорее всего, были простыми людьми, а родоначальника звали Трофимом, которого в быту звали Трохаем. Фамилия не содержит указания на занятие или сословие, но чётко говорит о личном имени предка — и это главное, что можно о ней сказать с уверенностью.