Фамилия Трошенины образована от имени собственного, но у её основы есть две версии, и обе уходят корнями в греческий язык. Имя Трошеня, от которого пошла фамилия, — это народная, уменьшительная форма сразу двух крестильных имён: Трофим и Митрофан.

Имя Трофим происходит от греческого слова Τρόφιμος, что переводится как «кормилец» или «питомец». Второй возможный источник — имя Митрофан, восходящее к греческому Μητροφάνης, то есть «матерью явленный». Оба имени в России были преимущественно крестьянскими, а к концу XIX века почти вышли из употребления, сохранившись лишь в фамилиях.

Словообразовательная модель здесь простая и характерная для русского севера и центра: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Трошенин буквально означает «сын Трошени», то есть потомок человека, которого в обиходе звали Трошеней. Такие формы на -еня (-оня) активно использовались в быту как ласкательные, поэтому основатель рода Трошениных, скорее всего, был человеком простого сословия — крестьянином или посадским.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, а письменные источники по крестьянским родам скудны. Однако по географии бытования фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России, где уменьшительные формы имён на -еня были особенно распространены.

Стоит отдельно сказать о написании: в дореволюционных документах фамилию могли фиксировать и как Трошенин, и как Трошенинов, но форма с одним суффиксом закрепилась как основная. Сегодня фамилия Трошенины встречается нечасто, но она сохранила память о тех тёплых домашних прозвищах, которыми звали предков в повседневной жизни, — и в этом её ценность как памятника славянской письменности и культуры.