Фамилия Троскунов образована от именования Троскун, которое восходит к средненемецкому слову trūt – «дорогой». Не исключено, что фамилия Траскунов образована от аналогичного прозвища, которое восходит к названию селения Трашкуны (Трошкунай), расположенного в Литве.