Фамилия Трусихин образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Трусихин, то есть сын или потомок Трусихи. Основа здесь — женское прозвище или нецерковное имя Трусиха. В русской ономастике фамилии на -ин часто происходили от женских прозвищ, если мужчина оставался без отца или жил в доме матери, либо если прозвище было дано женщине за характерный признак.

Корень «трус-» в данном случае не связан напрямую с современным значением «бояться». В древнерусском языке слово «трус» имело несколько значений. Первое — это «землетрясение», «колебание», «сотрясение» (отсюда «трусить» в смысле трясти). Второе — человек, который «трусит» в значении «мелко трясёт» или «суетится», возможно, непоседливый, беспокойный человек. Прозвище Трусиха могла получить женщина с живым, подвижным характером, которая постоянно в движении, или же, наоборот, та, кого трясёт от болезни или слабости. Третье, более позднее значение — «робкий» — стало основным только в XVII–XVIII веках, так что у ранних носителей фамилии боязливость вряд ли была главной чертой.

Словообразовательная модель с суффиксом -их- характерна для северных и сибирских говоров, где прозвища на -иха активно давали женщинам, а затем от них образовывали фамилии. Например, Трусиха — жена или вдова Труса (если мужчина имел прозвище Трус). Фамилия Трусихин встречается в документах по Вологодской и Архангельской губерниям, а также на Урале. В переписях XVIII–XIX веков она фиксируется у крестьян и мещан, что типично для фамилий, возникших в среде сельского населения.

Однокоренные фамилии — Трусов, Трусихин, Трусихин — стоят в одном ряду. Трусихин отличается тем, что прямо отсылает к женскому прозвищу, что делает её более редкой и специфичной. Споров о происхождении корня почти нет: все версии укладываются в круг значений «тряска» или «суета», и лишь в отдельных случаях можно предположить связь с диалектным «трусить» (экономить, крохоборничать), но это менее вероятно, так как такое значение локально и не дало массовых прозвищ.