Фамилия Трусыхин — редкий случай, когда основа читается почти как готовое слово, но на самом деле скрывает за собой не трусость, а, скорее всего, прозвище, связанное с движением или звуком. Корень здесь — «трус», но не в современном значении «боязливый человек», а в древнерусском глаголе «трусити» — трясти, сотрясать, сыпать. В старину «трусом» называли землетрясение, а «трусилой» — человека, который трясёт что-то, например, мешки с зерном или плоды с дерева. Так что первый Трусыхин мог быть не пугливым, а деятельным — трясуном, возчиком или тем, кто работал на гумне, отделяя зерно от мякины.

Суффикс «-ыхин» — один из самых редких в русской фамильной системе. Он характерен для северных и сибирских регионов, особенно для Архангельской, Вологодской и Вятской губерний. Обычно такие фамилии образовывались от прозвищ, которые заканчивались на «-ыха» или «-уха»: Трусыха — так могли назвать женщину или мужчину по характерному действию (например, «трясущаяся» от работы или «трусящая» семена). Затем к основе добавили притяжательный суффикс «-ин», но с вставкой «-ых-» по аналогии с другими фамилиями вроде Широкихин или Глухихин. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть в среде, где ценили прозвища по поведению или занятию, а не по отчеству.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с именем Трофим. В народном произношении «Трофим» могло превратиться в «Труха» или «Трус» через упрощение (сравните: Трофим → Труха → Трусыхин). Но тогда фамилия должна была бы писаться через «ф» или иметь другую огласовку, так что версия с глаголом «трусить» убедительнее. В любом случае, фамилия Трусыхин — не про страх, а про старую русскую работу или бытовую кличку, которую закрепили за родом на севере страны.