Фамилия Трусилин образована по продуктивной модели с суффиксом -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — «Трусилин» значит «сын Трусилы» или «человек из рода Трусилы». Основа здесь — прозвище Трусила, которое, в отличие от созвучных слов с корнем «трус-», не обязательно несло отрицательный смысл. В древнерусском языке «трусити» значило не только «бояться», но и «трясти», «колебать», «сотрясать» — отсюда «трус» в значении «землетрясение» (сохранилось в летописях). Соответственно, Трусилой могли прозвать человека суетливого, непоседливого или того, кто «трясётся» от работы, а не от страха.

Вторая версия, более бытовая, связывает прозвище с глаголом «трусить» в современном значении — бояться. В этом случае Трусила — ироничное или обидное прозвище для робкого человека, которое затем закрепилось как фамилия. Подобные «характерологические» фамилии (Храбров, Смелов, Бояринов) были распространены на Руси, но Трусилин стоит в ряду тех, где прозвище могло быть дано «от противного» — в насмешку или как предостережение.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям. Встречается в старых переписях Тульской, Рязанской и Воронежской губерний — регионах, где активно бытовали прозвищные формы на -ила (Крутила, Вертила, Трусила). В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель с суффиксом -ин от прозвищ на -ила описывается как типичная для северо-восточных и центральных говоров, что косвенно подтверждает корни фамилии именно в этих краях.

Интересно, что фамилия Трусилин не имеет «дворянского» звучания: она не встречается в родословных книгах знати и не образована от крестильного имени. Это типичная крестьянская или посадская фамилия, возникшая в XVI–XVII веках, когда прозвища окончательно переходили в наследственные именования. Носители фамилии, скорее всего, были землепашцами, ремесленниками или служилыми людьми «по прибору» — теми, кто получал прозвище от окружающих за манеру поведения или внешность.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Трусов, Трусихин, Трушкин) показывает, что Трусилин — одна из редких форм: суффикс -ин при основе на -ил встречается реже, чем -ов. Это делает фамилию более локальной и, возможно, указывает на конкретный род, где прозвище Трусила закрепилось за основателем, а не за всей общиной.