Фамилия Труженикова — одна из тех, что прямо указывает на занятие или социальную характеристику предка. В её основе лежит слово «труженик», то есть человек, который много и усердно работает. Однако, в отличие от, скажем, фамилии Кузнецов, здесь заложен не профессиональный, а скорее оценочный смысл: предка могли прозвать Тружеником не за конкретное ремесло, а за отношение к делу — за трудолюбие, выносливость, неприхотливость.

Слово «труженик» — относительно позднее. В древнерусском языке чаще использовали «трудник» (от «труд» — работа, усилие). Форма на «-еник» закрепилась в литературном языке в XIX веке, но в народной речи могла бытовать и раньше. Поэтому фамилия Тружеников (и её женская форма Труженикова) — не древняя, а скорее поздняя, сформировавшаяся в эпоху, когда прозвища уже активно превращались в наследственные фамилии. По модели образования она абсолютно стандартна: основа «Труженик» + патронимический суффикс «-ов», означающий «сын Труженика» или «из семьи Труженика».

Интересно, что в русских говорах могло существовать и слово «труженик» как прозвище не только работящего человека, но и, например, крестьянина, который не нанимал батраков, а всё делал сам. В некоторых регионах так могли называть человека, который работал на других за плату — то есть наёмного работника. Таким образом, фамилия могла закрепиться как за зажиточным, но не ленивым хозяином, так и за простым батраком. Точнее сказать сложно — слишком размыт исходный признак.

Фамилия Труженикова встречается по всей России, но заметно чаще — в центральных и северных областях, где было развито отходничество и крестьянский труд ценился особенно высоко. Встречаются и варианты написания с одной «н» — Труженикова, но это скорее исключение, чем правило. В целом, это одна из немногих русских фамилий, где в основе лежит не имя, не ремесло, а моральная оценка человека, что делает её своеобразным памятником народной этике.