Фамилия Цифаркин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, прозвище, связанное с грамотностью или профессией. Она образована по стандартной модели: к основе «Цифарк» добавили суффикс принадлежности -ин, который указывает на родство: «чей?» — «Цифаркин», то есть сын или потомок Цифарки.

Сама основа «Цифарк» — это уменьшительная форма от слова «цифра». В старину «цифарью» (от латинского cifra) называли не только арифметические знаки, но и вообще всякую запись чисел, а также шифрованное письмо. Поэтому прозвище Цифарка мог получить человек, имевший дело с цифрами и счетами: писарь, счетовод, приказчик на торгах, сборщик податей или учитель арифметики. В крестьянской среде, где грамотность была редкостью, такой человек выделялся, и прозвище легко закреплялось за ним и его семьёй.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и в среде старообрядцев. У них «цифирью» называли особую систему записи чисел, отличную от арабской, и знатоков этой системы уважительно именовали «цифирщиками». Цифарка — уменьшительная форма, но не обязательно пренебрежительная, скорее обиходная, как «Ванька» от «Иван».

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основной ареал — центральные и северные области России (Вологодская, Архангельская, Кировская области), где в XVIII–XIX веках были сильны старообрядческие общины и где работало много грамотных приказчиков на лесных и соляных промыслах. Вероятно, фамилия не получила широкого распространения, так как была «профессионально» окрашена и не перешла в разряд массовых, как, например, Кузнецовы или Поповы.

Других версий, например, от тюркского или финно-угорского корня, нет: слово «цифра» в русском языке имеет чёткую книжную историю, и фамилия явно русская по словообразованию. Так что предки Цифаркиных были людьми, умевшими считать и писать, — редкое умение, которое и дало им фамилию.