Фамилия Цымаркин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд её можно принять за «географическую» фамилию, образованную от названия населённого пункта вроде Цымарка или Цымарь, но таких топонимов в доступных источниках не зафиксировано. Поэтому разумнее искать основу в прозвище или профессиональном имени.

Словообразовательная модель здесь стандартная для русского Северо-Запада и Поволжья: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Цымаркин — сын или потомок человека по прозвищу Цымара. Само прозвище Цымара могло возникнуть от глагола «цымарить» — в диалектах (особенно псковских и тверских) это значит «шарить, рыться, искать что-то украдкой», а также «воровать по мелочи». Соответственно, Цымаркой в народе могли называть нечистого на руку человека, мелкого воришку или просто суетливого, любопытного человека, который везде суёт нос.

Вторая версия — от слова «цымарка» в значении «мелкая рыбёшка, малёк». В таком случае прозвище могло быть ироничным: так дразнили низкорослого или щуплого мужчину. Учитывая, что фамилия Цымаркин встречается в основном в южнорусских и украинских областях (по данным современных телефонных справочников — Курская, Белгородская области, а также Харьковщина), рыболовная версия не лишена оснований: в этих краях слово «цымарка» знают как название мелкой плотвы или уклейки.

Третья, менее вероятная гипотеза — еврейское происхождение. В идише есть слово «цимар» (צימער) — «комната», а «цимарник» — постоялец, квартирант. Однако суффикс -ин в еврейских фамилиях встречается редко, обычно они оформляются через -ов/-ев или -ский. К тому же фамилия Цымаркин не фигурирует в списках типичных еврейских фамилий Российской империи. Так что эта версия спорна.

Сословная принадлежность предков Цымаркиных — скорее всего, крестьянство или мещанство. В ревизских сказках XIX века такая фамилия не попадается среди дворян или купцов, а значит, её носители были людьми простого звания, получившими фамилию по уличному прозвищу при переписях после отмены крепостного права.

Коротко: Цымаркин — прозвищная фамилия, скорее всего, от диалектного «цымарить» (воровать, шарить) или от названия мелкой рыбы. Корень — народный, не книжный, поэтому точное значение можно установить только зная, в какой именно местности жили первые носители.