Фамилия Цигин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет распространённого суффикса -ов/-ев, что сразу указывает на нерусскую или искусственную основу. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от прозвища или иноязычного имени.

Наиболее вероятная версия связывает Цигина с еврейским именем Циг (Цигель) — уменьшительной формой от имени Ицхак (Исаак). Суффикс -ин в русских фамилиях традиционно указывает на принадлежность: «чей?» — Цигин, то есть сын или потомок Цига. Эта модель типична для фамилий, возникших на территории Российской империи, где еврейское население получало фамилии по отцу или прозвищу. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия Цигин встречается в основном в регионах бывшей черты оседлости — на Украине, в Белоруссии, в южных областях России.

Есть и другая, менее убедительная гипотеза: от слова «цига» — так в некоторых южных говорах называли цыгана. В этом случае фамилия могла быть прозвищем смуглого или кочевого человека. Однако для русского прозвища более естественным было бы окончание -ов (Цигов), а не -ин. Поэтому версия с еврейским именем выглядит предпочтительнее.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву «и» после «ц»: в дореволюционной орфографии часто писали «Цыгин», что могло дать ложную отсылку к слову «цыган». Современное «Цигин» закрепилось после реформы орфографии 1918 года, когда «цы» в корнях заменили на «ци» в большинстве заимствованных слов. Таким образом, носитель фамилии Цигин, скорее всего, потомок человека по прозвищу Циг, которое, в свою очередь, восходит к библейскому имени Исаак.