Фамилия Цинайкин образована от прозвища Цинайка. Вероятно, оно ведет свое начало от украинского слова «цина» - «олово». Таким образом, можно предположить, что основатель рода Цинайкиных был мастером, который занимался ремонтом оловянной посуды. Согласно другой версии, прозвище Цинайка связано с латышским глаголом cienāt - «угощать». В таком случае оно указывало на особенности характера человека: гостеприимство. Возможно, родоначальник Цинайкиных часто встречал гостей, угощал их различными яствами. Наличие балтийского корня может объясняться тем, что основатель рода Цинайкиных был выходцем из Латвии или Литвы (или Великого княжества Литовского), а затем он или его потомки переехали на территорию одного из славянских государств. Так и прозвище Цинайка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Цинайкин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Цинайка, со временем получил фамилию Цинайкин.