Фамилия Циплугин — редкий пример, где разбор упирается не в очевидный корень, а в тёмное прозвище. Основа здесь — «циплуг», слово, которого нет в современных словарях. Скорее всего, это диалектное или профессиональное прозвище, образованное от глагола «ципать» (щипать, отщипывать) с суффиксом -луг, как в «светлуг» (светлый) или «тяглуг» (тягло). Тогда Циплуг — человек, который щиплет, отрывает что-то мелкое: могло относиться к портному, работающему с тканью, или к крестьянину, обрабатывающему лён. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «сын Циплуга», то есть типичная русская патронимическая модель, характерная для северных и центральных областей.

Есть и другая, менее надёжная версия: связь с тюркским «цип» (цыплёнок) или «циплу» (цыплячий). Но словообразовательный суффикс -луг в русском языке встречается именно в диалектных прозвищах, а не в заимствованиях, поэтому первое объяснение правдоподобнее. Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Вятской и Пермской губерниях — регионах, где сохранялись архаичные говоры и ремёсла. Никаких известных дворянских родов или знаменитых носителей с этой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её крестьянское происхождение.

Особенность фамилии — в её уникальности: однокоренные «Циплугин» и «Циплугов» почти не встречаются в других вариантах. Если сравнивать с «Ципкиным» или «Ципаевым», то здесь корень не связан с цыплёнком, а именно с действием. Так что предки Циплугиных, скорее всего, были мастерами-ремесленниками, работавшими с мелкими деталями — щипали паклю, дергали лён или чинили сети.