Фамилия Цыбариус — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, а её окончание -ус сразу выдаёт латинское или, точнее, латинизированное происхождение. Перед нами не крестьянская или купеческая фамилия, а книжная, искусственная, возникшая в среде духовенства или, реже, в академических кругах.

В основе фамилии лежит корень «цыб-», который восходит к диалектному русскому слову «цыба» или «цыбка» — так в южных и западных говорах называли длинноногую, неуклюжую птицу (обычно цаплю или аиста), а также, переносно, долговязого, нескладного человека. Прозвище Цыба или Цыбарь давали высокому, худощавому человеку с длинными ногами. Когда в семинариях и духовных училищах начали массово заменять простонародные фамилии на более благозвучные, прозвище Цыба «облагородили», приделав к нему латинский суффикс -иус. Получилась фамилия, звучащая как учёное название растения или животного.

Откуда именно пошёл Цыбариус, сказать трудно: география фамилии крайне узкая. Судя по встречаемости в дореволюционных метрических книгах, основное ядро носителей — выходцы из южнорусских и западнорусских губерний (Киевская, Подольская, Волынская), где диалектное слово «цыба» было в ходу, а семинарская традиция латинизации процветала. Вероятно, фамилию дали в каком-то конкретном училище или семинарии, и она осталась локальной.

Сословно Цыбариусы почти наверняка происходят из духовного звания. В крестьянской или мещанской среде такую «учёную» фамилию не придумали бы. Встречаются также единичные случаи, когда фамилию получали дети псаломщиков или дьячков, учившиеся в бурсе. После отмены обязательного духовного образования в XIX веке часть Цыбариусов ушла в светские профессии — учителя, чиновники, врачи, но корень остался семинарским.

С точки зрения словообразования фамилия уникальна: суффикс -иус в русских фамилиях встречается редко и почти всегда указывает на искусственное происхождение. Сравните с однокоренными, но более простыми вариантами: Цыбин, Цыбов, Цыбарь. Цыбариус — их «латинизированный» родственник, сохранивший память о прозвище предка и о той среде, где простонародную кличку превращали в фамилию для паспорта.

Если ваша фамилия Цыбариус, велика вероятность, что предки были людьми книжными — учились по грамматикам и псалтырям, а прозвище им дали за рост или походку. Никакого отношения к римским патрициям, вопреки звучанию, она не имеет.