Фамилия Цыберман — почти наверняка искусственная, созданная в канцелярии, а не укоренившаяся в народе. Её основа — немецкое слово Zuber, которое в южных диалектах означает «чан», «кадка» или «ушат». Второй элемент, -ман, — классический финал для фамилий ремесленников и должностных лиц (ср. Зайдельман, Вассерман). Получается, что Цыберман — это «человек, делающий чаны» или «бочар». Однако в реальной немецкой ономастике Zuber чаще встречается без суффикса -er, и фамилия Цуберман фиксируется, но как редкая.

Написание через «ы» — верный признак того, что фамилия осваивалась в идишской или восточнонемецкой среде, где звук «у» мог переходить в «и» или «ы» под влиянием местных говоров. В еврейских фамилиях, полученных в Российской империи в конце XVIII — XIX веке, часто встречается такой графический сдвиг: немецкое Zubermann превращалось в Цыберман, потому что чиновники записывали на слух, а не по правилам немецкой орфографии.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с немецким Zieber, Zieber (от ziehen — «тянуть», «тащить»). В этом случае фамилия могла обозначать возчика или бурлака. Но Zuber как основа встречается в словарях немецких фамилий (например, у Бахова или Готтшальда) чаще, чем Zieber, и семантика «бочар» — более конкретная и типичная для фамилий по ремеслу.

На территории бывшей Российской империи Цыберман — фамилия почти исключительно еврейская, распространённая в черте оседлости: на Волыни, в Подолии, в Бессарабии. Встречается также вариант Циберман, а в немецком написании — Zubermann. В отличие от фамилий на -ский или -ов, Цыберман не указывает на дворянское или крестьянское происхождение — это типичный пример фамилии, присвоенной по профессии или прозвищу в ходе массового приписывания фамилий еврейскому населению.