Фамилия Цынько — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, и это сразу подсказывает путь к разгадке. Основа здесь — «цын(ь)», а суффикс «-ко» типичен для украинской и южнорусской ономастики, где он часто указывает на уменьшительность или принадлежность к роду. Чаще всего фамилии на «-ко» образовывали от прозвищ, реже — от крестильных имён.

Ключ к значению — в корне. Самое прямое объяснение: прозвище Цынька могли дать человеку маленького роста, щуплому, невзрачному. Слово «цынка» в южных говорах (украинских и русских) означало «мелочь», «мелкая монета», «цыплёнок». Отсюда же — «цынгать» (чахнуть, болеть) или «цынгавый» (малорослый, тщедушный). Фамилия могла закрепиться за невысоким, худым мужчиной или за тем, кого в насмешку прозвали «мелочью».

Есть и другой, менее очевидный вариант. В некоторых говорах «цынькать» значило «звенеть» или «бренчать» — например, о пустой посуде или о металлическом звуке. Тогда прозвище могло получить тот, кто работал с металлом (кузнец, жестянщик) или просто говорил звонко, резко. Но эта версия слабее: первая, «мелкий/хилый», встречается чаще и логичнее объясняет фамилию.

Географически фамилия Цынько привязана к западу и югу России, а также к восточной Украине. Она не массовая, а значит, её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких соседних родов, разошедшихся по разным регионам. В дворянских родословных книгах эта фамилия не встречается — это однозначно крестьянская или казачья фамилия, образованная от бытового прозвища.

Особенность написания — мягкий знак в корне («Цынько»). Это редкий случай: обычно украинские фамилии на «-ко» обходятся без смягчения (Цинько, Цинка). Мягкий знак здесь, вероятно, отражает диалектное произношение — «цынь» с мягким «н», как в слове «конь». Это ещё раз подтверждает, что фамилия записана «на слух», а не по книжному правилу.