Фамилия Тугунов — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа — «тугун» — в современном русском языке не встречается, поэтому разбирать фамилию нужно через диалекты и тюркские заимствования, благо для этого есть все основания.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность (чей? — Тугунов), то есть «сын или потомок Тогуна». Само прозвище или имя Тугун могло возникнуть двумя путями. Первый — от тюркского «туг» (знамя, бунчук) с уменьшительным суффиксом -ун: Тугун — «маленькое знамя» или «знаменосец». В кочевых культурах туг был символом власти и воинской доблести, так могли прозвать воина, который нёс знамя, или же дать имя ребёнку, желая ему военной славы. Вторая версия — от тюркского глагола «туг» (рождаться) или «тугун» (родной, кровный). В этом случае Тугун — пожелательное имя, что-то вроде «родной, желанный».

География фамилии подсказывает, что версия с тюркским корнем — основная. Фамилия Тугунов распространена в Поволжье (особенно в Татарстане и Башкирии), а также среди калмыков. У калмыков даже есть фамилия Тугунова (женская форма), что напрямую отсылает к слову «туг» (знамя). В русских говорах слово «тугун» не фиксируется, поэтому версия о происхождении от какого-либо ремесла или предмета быта маловероятна.

Социально фамилия не элитарная: в дореволюционных списках Тугунова чаще всего встречаются среди крестьян и казаков. Тяжёлая артиллерия — дворяне Тугуновы — не отмечена. Значит, предки носителя фамилии были, скорее всего, служилыми людьми «по прибору» (казаками, стрельцами) или государственными крестьянами, получившими фамилию по прозвищу, которое дали ещё в XVI–XVII веках при контактах с тюркскими народами.

В написании фамилия устойчива: ударение почти всегда падает на второй слог — ТугУнов. Вариант ТугунОв встречается, но редко и, как правило, в калмыцкой среде.