Фамилия Вагура — редкая, компактная и неочевидная. В ней нет привычных патронимических суффиксов (-ов, -ин, -ский), поэтому её происхождение нужно искать не в отчестве, а напрямую в прозвище или заимствованном слове.

Самая вероятная версия — западнославянские или балтийские корни. В польском и белорусском языках «вагура» могло быть прозвищем от «wągry» — угри (прыщи). Слово «wągier» (ед. ч.) означало кожный дефект, и прозвище Вагура могли дать человеку с рябым или проблемным лицом. Такая модель прозвищ по внешним признакам (Рябой, Шишка, Кривой) типична для всех славян, но в русской среде фамилия могла закрепиться через выходцев из Речи Посполитой или через белорусское влияние на западных землях.

Вторая версия — украинская или южнорусская. В украинских говорах «вагура» могло быть вариантом слова «вага» — вес, тяжесть. Тогда прозвище Вагура означало «тяжеловес», «грузный человек» или даже «важный», «весомый» человек. Эта версия слабее, потому что суффикс -ур- нехарактерен для украинской прозвищной модели: обычно вес передают через «Важкий», «Ваговик». Но полностью исключать её нельзя: в диалектах встречаются единичные формы.

Фамилия почти не встречается в центральных и северных областях России. Основной ареал — западные регионы (Смоленщина, Брянщина, Псковщина), а также Украина и Беларусь. Это косвенно подтверждает первую версию: именно на этих территориях польско-белорусское влияние было сильным, и фамилии на чистую основу без суффикса (как Вагура, Банда, Гута) фиксируются чаще, чем в Великороссии.

Интересная деталь: фамилия Вагура могла возникнуть и как фонетический вариант фамилии Вагур (от немецкого Wagner — каретник, тележник), если носитель попал в польскую или украинскую среду и потерял конечное «н». Но это уже экзотическая гипотеза: слишком много допущений.

Итог: скорее всего, предок носителя фамилии Вагура получил прозвище по внешности (от «угрей» на лице) и жил на западе современной России или в Беларуси. Фамилия не дворянская, не крестьянская по сословному маркеру — просто прозвище, закрепившееся в документах.