Фамилия Вагурина — женская форма, а в основе лежит мужское прозвище Вагура. Чаще всего его связывают со словом «вага», которое в разных говорах имело непохожие значения. В центральных и южных областях вага — это гиря, весы или тяжесть. Тогда Вагурой могли прозвать либо весовщика (человека, работавшего с весами на торгу или складе), либо просто грузного, полного мужчину. В ярославских и северодвинских говорах вагой называли грубоватого или ленивого человека, а в архангельском и вологодском — шалуна, балагура, весельчака. Выходит, что прозвище Вагура могло указывать на характер или поведение предка.

Стоит учесть и топонимическую версию. Вагурой могли назвать человека, жившего на берегу реки Ваги — крупного притока Северной Двины. Такие «речные» прозвища были распространены на Русском Севере и нередко закреплялись в фамилиях.

Есть и третья, менее очевидная гипотеза, которую приводят ономасты. Фамилия может восходить не к прозвищу, а к имени Вага — сокращённой форме редкого крестильного имени Евагрий. В переводе с греческого оно означает «счастливый на охоте». Если это так, то фамилия Вагурина — не от мирского прозвища, а от церковного имени, которое со временем перешло в фамилию через отчество.

Фамилия образована при помощи типичного для русского Севера и Поволжья суффикса -ин: Вагура → Вагурин → Вагурина. Такая модель указывает на принадлежность потомку человека по имени или прозвищу Вагура.

Таким образом, предок современных Вагуриных мог быть весовщиком, весёлым человеком, жителем берегов Ваги или даже носителем редкого греческого имени. Какая из версий верна для конкретной семьи — зависит от её географических корней и семейных преданий.