Фамилия Вакариан — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она кажется иноязычной, но при разборе по словообразовательной модели выясняется, что перед нами, скорее всего, русифицированная версия фамилии с армянскими или, реже, греческими корнями.

Ключ к разгадке — конечный элемент -ян. В русской ономастике суффикс -ян/-янц однозначно указывает на армянское происхождение. В армянском языке он образует фамилии со значением принадлежности («из рода такого-то»). Основа Вакар- — это либо армянское имя Вакар (встречается в диаспоре), либо топоним Вакар (название села в Армении). Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть у греков Приазовья, где тоже встречается суффикс -ян (как вариант греческого -оглу), но для греческой фамилии основа Вакар нетипична.

В России и на постсоветском пространстве фамилия Вакариан — штучная. Она не встречается в массовых боярских или крестьянских переписях XVII–XIX веков, что косвенно подтверждает её позднее появление вместе с миграцией армянского населения. Если предки носителя фамилии жили в Российской империи, то, скорее всего, они были переселенцами из Закавказья или Крыма, где армянские общины были многочисленны.

Фамилия не имеет отношения к русским словам «вакация» (каникулы) или «вакансия» — это случайное созвучие. Ударение, судя по моделям армянских фамилий, падает на последний слог: Вакариа́н. В бытовой русской речи допустим и вариант с ударением на «а» (Вака́риан), но он стирает национальный колорит фамилии.