Фамилия Вахнин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Вахнин послужило церковное имя Иоанн. Мужское крестильное имя Иоанн в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Христианство прибавило к имени только одну букву «и» (Иван). Поэтому от него было образовано множество уменьшительных форм: Ивась, Иваш, Ваня, Ванечка, Ванюта, Ванята, Вахня. Последняя производная форма этого имени и легла в основу фамилии Вахнин. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вахня, со временем получил фамилию Вахнин. О точном месте и времени возникновения фамилии Вахнин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вахнин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.