Фамилия Вальковская — женская форма фамилии Вальковский. Её основа — имя или прозвище Валько. Чаще всего Валько считают сокращением от крестильных имён Валентин или Валерий. Оба восходят к латинскому valeo — «быть сильным, здоровым». У имени Валент (той же основы) есть небесный покровитель — святой мученик Валент, диакон Елийской церкви, известный знанием Священного Писания в преклонном возрасте.

Но это не единственная версия. В русских говорах вальком называли округлый долгий брусок — деревянный или из другого материала. Прозвище Валько могли дать полному, дородному человеку, по сходству с такой формой. Обе гипотезы имеют право на существование, хотя версия с личным именем встречается чаще.

Фамилия образована по типичной для польской и западнорусской традиции модели: к основе Вальк- добавили суффикс -овск-/-евск- и окончание -ая/-ий. Такие фамилии на -ский первоначально указывали на принадлежность роду или месту: Вальковский — «из рода Валько» или «вальковский» (то есть связанный с местностью, названной по Вальку). В русском обиходе фамилия закрепилась через притяжательную форму: потомок человека по имени или прозвищу Валько.