Фамилия Ванновский — редкий случай, когда происхождение почти не вызывает споров у ономастов, но при этом история фамилии неожиданно связывает носителя с польским шляхетским родом, а не с русским духовенством или крестьянством.

Основа фамилии — Ваннов. Это древнее польское имя или прозвище, образованное от корня «ван» — в старопольских диалектах так называли лодку или челн, выдолбленный из цельного дерева. Суффикс -ов в основе указывает на принадлежность: Ваннов — «сын Вана» или «человек, связанный с Ванном». Второй суффикс -ский (польск. -ski) — типично дворянский формант, который в Польше и на западнорусских землях закреплял за фамилией статус шляхетской. То есть Ванновский — это не «сын Ванна», а «владелец поместья Ванново» или «выходец из Ваннова». Такая модель (имя + -ов + -ский) характерна для польской шляхты XVI–XVII веков, когда родовые прозвания превращали в территориальные фамилии.

Спорных версий практически нет. Иногда пытаются связать фамилию с церковнославянским «ванна» (купель) — якобы предок служил при крестильне, — но это натяжка: слово «ванна» в значении «сосуд для омовения» вошло в русский язык поздно, через немецкое посредничество, и не могло дать прозвища в допетровскую эпоху. Ещё реже встречается гипотеза о связи с тюркским «ван» (господин, правитель) — но для фамилии на -ский такое объяснение выглядит искусственным.

В Российской империи фамилия Ванновский закрепилась в основном за потомками польской шляхты, перешедшей на русскую службу после разделов Речи Посполитой. Самый известный носитель — военный министр России Пётр Семёнович Ванновский (1822–1904), чей род был внесён в дворянские книги Киевской губернии. Его фамилия — не случайное совпадение, а прямое указание на польское происхождение: предки министра владели имением Ванново на Волыни.

В современной России фамилия встречается редко, в основном на юго-западе страны и в Москве. Её носители, скорее всего, потомки обрусевшей шляхты, сохранившие фамилию в исходной польской форме — с окончанием -ский, а не переделанным в -ов.