Фамилия Варлашкины образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. В её основе лежит церковное имя Варлаам. Мужское крестильное имя Варлаам, возможно, происходит от халдейских слов со значением «сын» и «дородность, тучность». С арамейского языка имя Варлаам переводят как «сын Божий». В историю христианства вошли восемь святых, носивших это имя. Один из них, Варлаам Серпуховский, ещё при жизни имел дар чудотворения и удостоился видения Матери Божией.

Однако фамилия Варлашкины образована не напрямую от полной формы имени, а от его разговорного варианта — Варлашка. Уменьшительно-ласкательный суффикс -шк- в русских именах (ср. Ваня — Ванюшка, Тимофей — Тимошка) придавал имени бытовой, домашний оттенок. На Руси такие формы нередко становились основой для фамилий, особенно в среде крестьян и посадских людей, где полное церковное имя в повседневной речи часто заменяли более простым.

Суффикс -ин в фамилии Варлашкин (в форме множественного числа — Варлашкины) указывает на принадлежность: «чей?» — Варлашкин, то есть сын или потомок Варлашки. Такая модель типична для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ин столь же распространены, как и на -ов на юге и востоке.

О точном месте и времени возникновения фамилии Варлашкины сейчас говорить сложно — процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XVI по XIX век. Однако можно предположить, что предки носителей этой фамилии жили в тех областях, где имя Варлаам было особенно почитаемо, например, в Подмосковье или на Русском Севере, где существовали монастыри, связанные с этим святым.

В отличие от многих фамилий на -ов, которые образуются от полных или усечённых форм имён, Варлашкины демонстрируют редкий случай бытовой, «домашней» основы. Это делает фамилию не просто памятником славянской письменности и культуры, но и живым свидетельством того, как церковное имя, пройдя через народное произношение, закрепилось в родовом прозвании.