Фамилия Варначов образована от прозвища Варнак, которое восходит к нарицательному «варнак» - так называли каторжных в Сибири, бежавших из тюрьмы или с места поселения. Впоследствии «варнаками» стали нарекать всех сибирских бродяг. Возможно, что это прозвище указывало на социальный статус предка. Существительное «варнак» произошло от глагола «варнакать» - «болтать». Поэтому можно предположить, что Варнаком называли и также разговорчивого человека. Не исключено, что прозвище Варнак восходит к нарицательному «вар» - «кипяток». Глагол «варначить» имеет значение «кипеть». Это даёт основание полагать, что Варнаком могли наречь человека за его эмоциональность и вспыльчивость. Согласно ещё одной гипотезе, фамилия Варначов ведет свое начало от названия болгарского города Варна, который был основан в VI веке до н. как греческая колония. Город Варна также является крупным портом. Поэтому, основатель фамилии Варначовых мог быть уроженцем этого города или жил там в силу своей профессиональной деятельности. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Варнак, со временем получил фамилию Варначов.