Фамилия Варшутин — редкий случай, когда основа не бросается в глаза и не лежит на поверхности. На слух она кажется то ли иноязычной, то ли заковыристо-русской. На деле всё проще: перед нами типичная русская фамилия, образованная по модели «прозвище + суффикс -ин». Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей сын?» — Варшутин, то есть сын Варшуты.

Ключ к разгадке — само прозвище Варшута. Скорее всего, это производная форма от канонического имени Варфоломей. В народе это длинное имя перекраивали на свой лад: Варфоломей превращался в Варшу, Варшуту, Варюшу. Уменьшительно-бытовые имена на -ута (как Мишута от Михаил, Данута от Даниил) были характерны для северных и центральных говоров. Таким образом, Варшутин — потомок человека, которого в быту звали Варшутой, то есть Варфоломеем.

Второй вариант, более редкий, но не исключённый: основа могла быть связана с диалектным словом «варшута» — так в некоторых говорах называли ворчуна, брюзгу или неуживчивого человека. Глагол «варшить» кое-где означал «ворчать, браниться». Если это так, то фамилия пошла от прозвища по характеру. Однако первая версия (от имени Варфоломей) выглядит убедительнее, потому что модель «имя + -ута» давала множество фамилий, а прозвищная основа с корнем «варш-» встречается редко и слабо зафиксирована в источниках.

Географически фамилия Варшутин тяготеет к Поволжью и Уралу. Встречается она негусто, но стабильно в Кировской, Нижегородской областях, в Пермском крае и в Удмуртии. Это косвенно подтверждает севернорусские корни: именно оттуда в XVII–XVIII веках шло заселение этих земель, и именно там любили уменьшительные формы на -ута. Варшутины — скорее всего, потомки государственных крестьян или однодворцев, а не дворянского рода: фамилии на -ин от прозвищ и имён в этой среде были обычным делом.

В написании фамилия устойчива: вариант Варшутин встречается в документах последовательно, без путаницы с Варшутовым или Варшутиным. Двойное написание через «о» (Варшутов) было бы логично, если бы основа оканчивалась на твёрдый согласный, но раз мы видим -утин, значит, исходное прозвище звучало именно как Варшута.