Фамилия Варьян звучит непривычно для русского уха, и это не случайно. Её происхождение, скорее всего, не связано с исконно славянскими корнями, а указывает на западное или южноевропейское влияние. Основная версия — фамилия образована от варианта личного имени Варьян, которое является народной формой христианского имени Варлаам (в греческой традиции — Варлаам, в просторечии часто сокращалось до Варьян). Имя Варлаам имеет древнееврейское или арамейское происхождение и означает «сын народа» или «сын Божий» (в зависимости от толкования). Таким образом, Варьян — это патроним, то есть фамилия, указывающая на отца по имени Варьян (Варлаам). В русской среде такая модель образования (прозвище или имя без суффикса) встречается реже, чем фамилии на -ов/-ев, что подчёркивает её нетипичность.

Однако есть и альтернативная, более прозаичная версия. В южных и западных регионах Российской империи (на Украине, в Белоруссии, в Польше) слово «варян» или «варяг» могло означать «чужеземец», «пришлый человек» (от скандинавского «варяг» — наёмный воин, торговец). В таком случае прозвище Варьян давали человеку, который пришёл издалека, говорил с акцентом или имел необычную внешность. Эта версия менее популярна у ономастов, но имеет право на существование, особенно если носители фамилии исторически связаны с украинскими или польскими землями.

Стоит обратить внимание на суффикс. Отсутствие типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский) говорит о том, что фамилия могла закрепиться в форме, близкой к исходному прозвищу, без дополнительного оформления. Это характерно для фамилий, которые возникли в среде польской или украинской шляхты, где прозвища нередко переходили в фамилии без изменений. В русском языке фамилия Варьян встречается крайне редко, и её носители, скорее всего, имеют предков из числа крестьян или мещан западных губерний, либо из духовного сословия (священники нередко носили фамилии, образованные от имён святых, как Варлаам). Географически фамилия может быть сосредоточена в Белоруссии, на Волыни или в Подолье, хотя точных статистических данных по ней нет.